A Simple Perl CGI
HOME

Repeats regions & their secondary structure in the PDBID : 3vkh_A

>3vkh_A mol:protein length:3367 Dynein heavy chain, cytoplasmic
2325-2445
QYADKKITK.TSFLDSSFMKNLESaLRFGCPLLVQDVENIDPVLNP......VLNKEIRkkGGRIlirlgDQDVDFS..PSFMIFLFTrdPTAhFTPDLcSRVTFVNFTVTPSSLQSQCLH..EALkterPD
2923-3038
RYIPLGWTKfFEFNDADLRGALDS.IDYWVDLYSKGRSNIDPDKIPwiavrtILGSTIY..GGRI.....DNEFDMRllYSFLEQLFT..PSA.FNPDF.PLVPSIGLSVPEGTTRAHFMKwiEAL....PE
HSSSS x BSSSTHHHHHHHHxHHHH B BB GGG TTSTxxxxxxTTTT xx xxxxx xx xx Bx EE xS TT HHHHHTSEEEE xx HxxxxHH
GGTTTS SSx HHHHHHHHHxHHHHHHHHSSSS S GGGSxxxxxx HHHHHHxxHTIIxxxxxIIIGGG xx HHHHHHHxxHHHxHHHHSxSGGGGSTT EEETTTTEE xx SSxxxxHH
195-207
WDDLFNKLAEHLN
228-240
WDDRLNKVRSLLD
HHHHHHHHHHHHH
HHHHHHHHHHHHH
318-347
KALGEYLERQRSAFARF.YFVGDEDLLEIIG
350-380
KDIIKIQKHFRKMFAGLaNLTLDDEKTTIIG
HHHHHHHHHHHHHSGGGxGGS HHHHHHHHH
S THHHHTTGGGTSSSExEEEEE TTSSEEE
2065-2093
EPNFITSIINYdTKKMMTPKIREAITKGY
2096-2123
DPGFDYETVNR.ASKACGPLVKWATAQTY
TTHHHHHHT x TT TTTHHHHHHHH
TT HHHHHHxH TTHHHHHHHHHHHHH
2209-2222
GRWEQqseNFNTQM
2240-2250
GFFDQ...NFRTDL
HHHHHxxxHHHHHH
GGS HxxxHHHHHH
431-462
QVD......VNDHSKYSEWVdnyptqlvllTSQIVWST
463-495
QVDQALGGGTLQQSKIQEQL.....qsieqTTQMILNN
496-515
LADSVLQDLSAQKRKKFEHL..................
TS xxxxxxSS HHHHHHHHxxxxxxxxxxTTS HHHH
HHHHTTTBS S HHHHHHHHxxxxxxxxxxHHHHHHHH
HHHHTTS HHHHHHHHHHxxxxxxxxxxxxxxxxxx
951-967
DQLFGslDLTTREWT..DG
978-994
DNVRG..ESTKRHWIifDG
HHHT xxEEETTTTExxEE
TTSS xxGGGSEEEExxEE
1169-1195
RVLNSFFSLMNRSIvNVIEYNQLhSDF
1209-1233
RLLYSLMWGLGGSM.GLVERENF.SKF
HHHHHHHHHHHHHHxHHHHHHTTxT S
HHHHHHHHHSSTTBx HHHHHHHxHHH
1346-1390
LLLKTFDHHCEYKRT.PSGETVLRPTQlGKWLVvfCDEINLPSTDK
2627-2669
FLLKGGDNLTSIKETiPQLDSLLSTTQ.QKWLI..CLRQQVPSFSK
HHHHHHTTTEEEE xTTS EEEESSxTT EExxEEEESSTT
HHHTSSTT TT x GGGTTT HHxHHHHHxxHHHHHS GGGS
1950-1980
LDVKN.EQANQKLKQMVqDQQAAEIKQKDARE
1985-2015
LDVRNkEIAVQKVKAYA.DLEKAEPAIIEAQE
HHHHHxHHHHTHHHHHHxHHHHHHTHHHHTSG
TTHHHxHHTHHHHHHHHxHHGGGTSTHHHHHH
1680-1700
NNNYKSSDFDDDLRMLLkrAG
1712-1730
ESNVLESSFLERMNTLL..AG
TT HHHHHHHHHHHHxxHH
GGG STHHHHHHHHHHxxHH
93-115
NLIKIYLKGNAIITDLHSEAIKD
119-141
KILKKRLNTNWIITELTLGSIWD
751-776
YSQG...FKTAEVLAGKIVplfKLCQ.EQL
782-808
YDFGlraLKSVLVSAGGIK...RKCQpPQL
HTTTxxx SSHHHHHHHHHxxxHHHHxHHT
SxxxHHHHHHHHHHHHxxxHHHTxTS
1836-1848
YIAPPvfIQEAEI
1870-1880
YIHQT..IGEANI
HxxHHHHHH
HHHHHxxHHHHHH
2135-2167
REEVEQLENAANELKLKQDEIVATItalEKSIA
2170-2199
KEEYATLIRETEQIKTESSKVKNKV...DRSIA
SGGGHHHHHxxxHHHHH
TTSHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHxxxHHHHH
31-69
IQDLKAVWVElSNTWQEID...SLKETAWSaIIPRKVrKSLE
1234-1272
IQTIAITPVP.ANTIPLLDysvSIDDANWS.LWKNKV.PSVE
x xxx x x
HHHH S x TTS GGGxxxB TTT x BTTx
690-728
NSKEvELLGGKNISLHQDMGIFVTMNPG...YAGRSNLPDNL
1761-1801
DSEE.ELYKYFTSQVRRNLHVVFTMNPAspdFHNRSATSPAL
T SExE EE TT EEEE B xxx BTTB S TT
SHHxHHHHHHHHHHHTT EEEEE SSxxx TTTTHHHHT
PDB View PDBsum View Pfam View

Repeats regions & their secondary structure in the PDBID : 3vkh_B

>3vkh_B mol:protein length:3367 Dynein heavy chain, cytoplasmic
2325-2445
QYADKKITK.TSFLDSSFMKNLESaLRFGCPLLVQDVENIDPVLNP......VLNKEIRkkGGRIlirlgDQDVDFS..PSFMIFLFTrdPTAhFTPDLcSRVTFVNFTVTPSSLQSQCLH..EALkterPD
2923-3038
RYIPLGWTKfFEFNDADLRGALDS.IDYWVDLYSKGRSNIDPDKIPwiavrtILGSTIY..GGRI.....DNEFDMRllYSFLEQLFT..PSA.FNPDF.PLVPSIGLSVPEGTTRAHFMKwiEAL....PE
HTSTT EExEESSSTHHHHHHHHxHHHHT EEEE GGG GGGHxxxxxxHHHT xx xxxxx xx xx xEEEEExS TT HHHHTT EEEE xx HxxxxHH
GSTTTS SSx HHHHHHHHHxHHHHHHHHS SS S GGGSxxxxxx HHHHHHxxHHTTxxxxxTTSTTS xx SHHHHHHHxxHHHxHHHHSxSGGGGSTT EEETTTTEE xx SxxxxHH
195-207
WDDLFNKLAEHLN
228-240
WDDRLNKVRSLLD
HHHHHHHHHHHHH
HHHHHHHHHHHHH
318-347
KALGEYLERQRSAFARF.YFVGDEDLLEIIG
350-380
KDIIKIQKHFRKMFAGLaNLTLDDEKTTIIG
HHHHHHHHHHHHHSGGGxGGS HHHHHHHHH
T HHHHGGGHHHHSSSExEEEEE SS EEE
2065-2093
EPNFITSIINYdTKKMMTPKIREAITKGY
2096-2123
DPGFDYETVNR.ASKACGPLVKWATAQTY
x
x
2209-2222
GRWEQqseNFNTQM
2240-2250
GFFDQ...NFRTDL
HHHHTxxxSHHHHH
GGS HxxxHHHHHH
431-462
QVD......VNDHSKYSEWVdnyptqlvllTSQIVWST
463-495
QVDQALGGGTLQQSKIQEQL.....qsieqTTQMILNN
496-515
LADSVLQDLSAQKRKKFEHL..................
TS xxxxxxTT HHHHHHHHxxxxxxxxxxTTS HHHH
HHHHHH SS S HHHHHHHHxxxxxxxxxxHHHHHHHH
HHTGGGS HHHHHHHHHHxxxxxxxxxxxxxxxxxx
951-967
DQLFGslDLTTREWT..DG
978-994
DNVRG..ESTKRHWIifDG
HHHH xx B SSS xxB
TTTTSxxGGGEEEEExxEE
1169-1195
RVLNSFFSLMNRSIvNVIEYNQLhSDF
1209-1233
RLLYSLMWGLGGSM.GLVERENF.SKF
HHHHHHHHHHHHHHxHHHHTHHHxH T
HHHHHHHHHSSTTBx HHHHHHHxHHH
1346-1390
LLLKTFDHHCEYKRT.PSGETVLRPTQlGKWLVvfCDEINLPSTDK
2627-2669
FLLKGGDNLTSIKETiPQLDSLLSTTQ.QKWLI..CLRQQVPSFSK
HHHHTTTTTEEEEEExTTTEEEEEESSxTTSEExxEEEEESTT S
HHHTTTTTTTS x GGGTTTS HHxHHHHHxxHHHHHS GGGT
1950-1980
LDVKN.EQANQKLKQMVqDQQAAEIKQKDARE
1985-2015
LDVRNkEIAVQKVKAYA.DLEKAEPAIIEAQE
HHHHHxHHHHHHHHHHHxHHHHHHHHHHHHHT
HHHHHxHHHTT x
1680-1700
NNNYKSSDFDDDLRMLLkrAG
1712-1730
ESNVLESSFLERMNTLL..AG
TT HHHHHHHHHHHHxxHH
TTS STHHHHHHHHHHxxHS
93-115
NLIKIYLKGNAIITDLHSEAIKD
119-141
KILKKRLNTNWIITELTLGSIWD
S
HHHHHSS TTS SHHHHHH
751-776
YSQG...FKTAEVLAGKIVplfKLCQ.EQL
782-808
YDFGlraLKSVLVSAGGIK...RKCQpPQL
HHHTxxx SSHHHHHHHHHxxxHHHHxHHH
SxxxHHHHHHHHHHHHxxxHHHTxT
1836-1848
YIAPPvfIQEAEI
1870-1880
YIHQT..IGEANI
HxxHHHHHH
HHHHHxxHHHHHH
2135-2167
REEVEQLENAANELKLKQDEIVATItalEKSIA
2170-2199
KEEYATLIRETEQIKTESSKVKNKV...DRSIA
HHHHHHHHHHxxxHHHHH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHxxxHHHHH
31-69
IQDLKAVWVElSNTWQEID...SLKETAWSaIIPRKVrKSLE
1234-1272
IQTIAITPVP.ANTIPLLDysvSIDDANWS.LWKNKV.PSVE
x xxx x x
HHTT S x TTS GGGxxxEEE SSS xSEEEGGxG
690-728
NSKEvELLGGKNISLHQDMGIFVTMNPG...YAGRSNLPDNL
1761-1801
DSEE.ELYKYFTSQVRRNLHVVFTMNPAspdFHNRSATSPAL
T SBx B TT EEEE B xxx STT S GG
HxHHHHHHHHHHTTTEEEEEEB TTxxxSSSSTHHHHH
PDB View PDBsum View Pfam View